Ελεύθεροι επαγγελματίες, φορολογούμενοι με επιστροφή φόρου, υποθέσεις με μεγάλο εισπρακτικό ενδιαφέρον, υποθέσεις για τις οποίες εκκρεμεί η έκδοση πράξεων επιβολής φόρων βρίσκονται στην πρώτη γραμμή των φορολογικών ελέγχων μέχρι το τέλος του 2016 για τη Γενική Γραμματεία Εσόδων.
Σύμφωνα με την εφημερίδα «Έθνος», η Γραμματεία ζητεί από τους προϊσταμένους των ελεγκτικών υπηρεσιών να συντάξουν νέες λίστες φορολογικών υποθέσεων με στόχο να κλείσει το έτος με 4.000 πλήρεις φορολογικούς ελέγχους και 18.000 μερικούς από το Κέντρο Ελέγχου Φορολογούμενων Μεγάλου Πλούτου, το Κέντρο Ελέγχου Μεγάλων Επιχειρήσεων και τις Εφορίες.
Η αξιολόγηση των υποθέσεων γίνεται βάσει αυτοματοποιημένου μοντέλου με αντικειμενικά κριτήρια για την ανάλυση, εκτίμηση και εντοπισμό κινδύνων που αφορούν την απώλεια φορολογικών εσόδων από τη μη διενέργεια αποτελεσματικών φορολογικών ελέγχων.
Εκτός των 4 κατηγοριών φορολογούμενων που αναφέρθηκαν παραπάνω, στο στόχαστρο του ελεγκτικού μηχανισμού μπαίνουν και υποθέσεις που αφορούν διασταυρωτικούς ελέγχους ενδοκοινοτικών συναλλαγών, επικείμενες υπαγωγές στο άρθρο 99 του Πτωχευτικού Κώδικα, ανακτήσεις των αφορολόγητων αποθεματικών του άρθρου 169 του Ν. 4099/2012, επαναλήψεις διαδικασίας και προδικαστικούς ελέγχους.