Αντιφάσεις υπάρχουν στις καταθέσεις των κατηγορουμένων, που περιλαμβάνονται στη δικογραφία της πολύκροτης υπόθεσης του Βαγγέλη Γιακουμάκη. Επίσης, οι καταθέσεις δημιουργούν πολλά ερωτήματα για το τι συνέβη στην ψυχολογία του φοιτητή της Γαλακτοκομικής Σχολής τα ελευταία 24ωρα πριν από την εξαφάνισή του.
«Την τελευταία εβδομάδα έδειχνε να τον απασχολεί κάτι και μία ημέρα πριν εξαφανιστεί που ήταν να πάμε για καφέ αρνήθηκε να έρθει για πρώτη φορά χωρίς να μου πει το λόγο», εξομολογήθηκε ο στενότερος φίλος του 20χρονου αδικοχαμένου φοιτητή, σύμφωνα με τον Ελεύθερο Τύπο.
Οι αστυνομικοί ερεύνησαν κατά πόσο αυτό μπορεί να σχετίζεται με τις δύο επισκέψεις -στις 18 Ιανουαρίου και στις 3 Φεβρουαρίου 2015- στη Γαλακτοκομική Σχολή Ιωαννίνων του περσινού φοιτητή από την Κρήτη, ο οποίος φέρεται να πρωταγωνιστούσε στους τραμπουκισμούς με θύμα τον Βαγγέλη ένα χρόνο πριν. Αναπάντητο παραμένει το ερώτημα γιατί σε μία από τις τελευταίες επισκέψεις του εξωσχολικού νεαρού ο Γιακουμάκης κλειδώθηκε στο δωμάτιό του.
Οι αντιφάσεις επικεντρώνονται στο τι συνέβη όταν ο Κρητικός φοιτητής, κατηγορούμενος για άσκηση επικίνδυνων σωματικών βλαβών εις βάρος του Γιακουμάκη, επισκέφτηκε τη Σχολή τρεις ημέρες πριν από την εξαφάνιση του Βαγγέλη και το κατά πόσο ανέβηκε ή όχι στα δωμάτια των συμφοιτητών του.
Ο κατηγορούμενος υποστήριξε στην πρώτη κατάθεσή του στις 11 Φεβρουαρίου 2015 ότι «επιστρέφοντας από άδεια από το Στρατό πέρασα και πάλι από τη Σχολή για να πάρω το απολυτήριό μου. Αυτή τη φορά δεν ανέβηκα στα δωμάτια, αλλά κατέβηκαν τα παιδιά κάτω και πήγαμε για καφέ».
Σε κατάθεση φίλου του Βαγγέλη αναφέρεται, ωστόσο, το αντίθετο: «Στις 3 Φεβρουαρίου είδα τον περσινό φοιτητή να βαδίζει μόνος του στο διάδρομο του 1ου ορόφου και να κατευθύνεται προς τη σκάλα που οδηγεί στο δεύτερο όροφο και βρίσκεται κοντά στις ανδρικές τουαλέτες. Χαιρετηθήκαμε». Στον ίδιο διάδρομο ανέφερε στους αστυνομικούς ότι είδε τον κατηγορούμενο και δεύτερος μάρτυρας, ο οποίος κατάλαβε ότι κατευθύνεται προς τα δωμάτια των Κρητικών.
Μια άλλη αντίφαση σχετίζεται με το κατά πόσο ο κατηγορούμενος βρέθηκε την ημέρα εκείνη στο ίδιο καφέ με τον Βαγγέλη και κατά πόσο συνομίλησαν κατά τη διάρκεια διαδρομής που έκαναν με το ίδιο αστικό λεωφορείο με προορισμό την πόλη των Ιωαννίνων.