Ξένα είδη ζώων και φυτών απειλούν συχνά τη φυσική πανίδα και χλωρίδα της Ευρώπης. Οι «εισβολείς», επιβαρύνουν και την ανθρώπινη υγεία.
Η εισβολή και εξάπλωση ειδών σε ξένα οικοσυστήματα είναι η σημαντικότερη απειλή για τη βιοποικιλότητα μετά την ανθρώπινη επέμβαση στο φυσικό περιβάλλον.
Η αμβροσία είναι ένα από τα ισχυρότερα αλλεργιογόνα ζιζάνια. Πρωτοεμφανίστηκε στη βόρεια Αμερική και μεταφέρθηκε στην Ευρώπη από ακάθαρτα αγροτικά μηχανήματα και τροφές για πτηνά. Συγκαταλέγεται στα 1500 και πλέον είδη επιβλαβών φυτών που εντοπίζονται στην ΕΕ. Στους "εισβολείς" θα πρέπει να συμπεριλάβει κανείς και το «κουνούπι-τίγρη», υπεύθυνο για τη μετάδοση θανατηφόρων ασθενειών όπως ο πυρετός του Δυτικού Νείλου, το οποίο έχει εντοπιστεί και στην Ελλάδα. Αυτό και άλλα φυτά και ζώα απειλούν έντονα τα ενδημικά είδη στην Ευρώπη. Σημαντικές φθορές προκαλεί μεταξύ άλλων ο μυοκάστορας ή nutria. Το μήκους 65 εκ. περίπου τρωκτικό με καταγωγή από τη Βραζιλία είχε μεταφερθεί στην Ευρώπη εξαιτίας της γούνας του. Όταν η σχετική ζήτηση περιορίστηκε, πολλοί εκτροφείς άφησαν απλά ελεύθερα τα ζώα. Τις τελευταίες δεκαετίες οι μυοκάστορες εγκαταστάθηκαν κυρίως στην κεντρική και νότια Ευρώπη. Ιδιαίτερα σοβαρά προβλήματα προκαλεί το συγκεκριμένο είδος στην Ιταλία. Η nutria κοστίζει 4 εκ. ευρώ ετησίως στην Ιταλία, μόνο εξαιτίας των ζημιών στις καλλιέργειες και της χρηματοδότησης για τον έλεγχο της αναπαραγωγής της. Ο μυοκάστορας εξολοθρεύτηκε συστηματικά στη Μεγάλη Βρετανία κατά τη δεκαετία του 1920 ως επιβλαβές είδος.